Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms