Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbed3Q9D0L1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms