Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc77Q9CZH8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms