Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thumpd2Q9CZB3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thumpd2Q9CZB3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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