Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sgo1Q9CXH7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms