Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tdrd12Q9CWU0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms