Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rprd1bQ9CSU0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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