Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Sec61bQ9CQS8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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