Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Nicn1Q9CQM0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Nicn1Q9CQM0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms