Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms