Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nudt21Q9CQF3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nudt21Q9CQF3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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