Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nsmce3Q9CPR8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nsmce3Q9CPR8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms