Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rassf3Q99P51 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rassf3Q99P51 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms