Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap4Q99P47 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms