Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NsmfQ99NF2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NsmfQ99NF2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms