Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gins4Q99LZ3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
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