Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cstf3Q99LI7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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