Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp11Q99K46 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp11Q99K46 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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