Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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