Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlcd1Q99JT6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms