Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apobec3Q99J72 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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