Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim59Q922Y2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim59Q922Y2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms