Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Med28Q920D3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms