Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Afg3l1Q920A7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Afg3l1Q920A7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms