Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klc3Q91W40 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms