Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdk8Q8R3L8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdk8Q8R3L8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms