Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vmn1r200Q8R281 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms