Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ssh3Q8K330 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ssh3Q8K330 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ssh3Q8K330 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ssh3Q8K330 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ssh3Q8K330 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms