Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc12Q8K2L8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms