Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Cldn34c1Q8K193 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms