Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ctxn1Q8K129 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ctxn1Q8K129 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms