Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ercc8Q8CFD5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ercc8Q8CFD5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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