Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Snx8Q8CFD4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Snx8Q8CFD4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snx8Q8CFD4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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