Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp27Q8CEG8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp27Q8CEG8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Usp27Q8CEG8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp27Q8CEG8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp27Q8CEG8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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