Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup88Q8CEC0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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