Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Pramef8Q8CE24 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Pramef8Q8CE24 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Pramef8Q8CE24 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pramef8Q8CE24 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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