Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nhlrc3Q8CCH2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Nhlrc3Q8CCH2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nhlrc3Q8CCH2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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