Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Slfn5Q8CBA2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slfn5Q8CBA2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms