Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Atg4aQ8C9S8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg4aQ8C9S8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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