Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim47Q8C0E3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim47Q8C0E3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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