Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx16Q8C080 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Snx16Q8C080 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Snx16Q8C080 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx16Q8C080 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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