Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 1700063D05Rik-204ENSMUST00000213914 1007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Trim35Q8C006 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trim35Q8C006 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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