Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cep55Q8BT07 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms