Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tcaf1Q8BNE1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms