Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms