Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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