Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ7

BC048562, cDNA sequence BC048562, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048562Q80ZQ7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048562Q80ZQ7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048562Q80ZQ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms