Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TnnQ80Z71 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TnnQ80Z71 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms