Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Pja2Q80U04 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pja2Q80U04 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms