Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NischQ80TM9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NischQ80TM9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
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